Motorola Phone Tools（MPT）是否可以把我手机里的短信息备份到电脑里？是否可以把.jar文件传送到手机里？

这要看你是什么手机，在数据方面做的最好的手机是西门子，整个手机是文件夹结构的，存储空间自由分配。
关于你提的问题，moto自己出产的手机当然可以用这个软件备份短信，至于别的手机就要看他的系统设计是不是和moto一样了
.jar文件是手机的java程序，一般来说都可以用适合本品牌手机的数据传输软件传送到手机里面，但是具体的情况还是要由你的手机品牌和型号决定