What is it doing 什么意思

当然不能
What is it doing 它在干什么?
Yes,they are 是的,他们是
明显不对嘛

不能搭配。你的误区在于，回答yes,they are./no,they aren't这一类的问句通常是一般疑问句。例如：
A:Are they Chinese? B:No, they aren't.
他们是中国人吗？ 不是的。

而问句what is it doing? 为特殊疑问句，它的陈述句语序应该是It is doing something.这里对what提问，即提问“什么”。翻译为：它在做什么？
回答应该为：It is eating meat.它在吃肉。

可以．

what's it doing?
干什么呢？

yes, they are...
他们在干．．．

what is it doing回答要用实义动词ing。而yes they are只有Be动词无实义动词 ing

它在干什么?

不能搭配.

不能吧