我的电脑一开机，我的文档就自动跳出来，起动向里又找不到，注册表里的RUN项里也没有。

可能有浏览器插件,找找看,删了就可以了

病毒，是病毒，以前我电脑上也有，后来装了系统之后没了，一般杀毒软件都能杀出来的

使用360安全卫士看一下启动项

是种了U盘病毒,建议你到http://360safe.qihoo.com/custom/repair.html?pid=&uid=
下载,修复360安全卫士，使被木马破坏的360安全卫士重新正常运行；对破坏360安全卫士的木马具有专杀作用，帮助用户彻底清除此类木马。

运行~~~MSCONFIG命令~~~启动!!

这个是病毒，杀毒