为什么我的电脑新装了系统,(没个盘都格式化了的)以前的木马病毒还在啊?有什么好的网站可以下杀毒软件啊?

如果真是这样的话，那你的那个系统光盘有问题！
现在有些D版的光盘是有“高手”加了礼物在里面的。
杀木马用这个比较好：
木马杀客 5.2 绿色特别版
http://www.mmsk.cn/Down.html

至于杀毒软件：
这个网站有免费的（破解版、注册版）杀毒软件
www.riyou.com

推荐1款完全免费的正版杀毒软件
ClamWin 0.87
软件名称: ClamWin 0.87
软件类型: 电脑安全/免费软件
软件语言: 简体中文
运行环境: Win9X/Win2000/WinXP/
软件大小: 4.63 MB
ClamWin是一款开放源代码的自由软件，它使用同样开源且十分流行的 Clamav 作为引擎。可以说， ClamWin 就是 Windows 版本的 Clam AntiVirus 软件。该软件由志愿者维护。
引用官方网站上的说明：ClamWin Free Antivirus uses the GNU General Public License by the Free Software Foundation and is free (as in freedom) software。 ClamWin 支持的操作系统有 Windows 98、 Windows ME 、 Windows 2000、 Windows XP 和 Windows Server 2003。目前， ClamWin 只有英文版。
下载：http://www.xiazai