新公司法中规定：对重大事项进行表决时，需要以特别决议方式通过。

符合，公司章程属于私人意思自治范畴，在不违反强制性法律规定的情况下是具有最优效力的，也就是说，公司法的规定仅设定底线，只能更高，不能更低。
从另一方面理解，章程是各股东意思协商一致的产物，有异议的话就应该在协商阶段解决，既然协商一致，在不违法的情况下没理由不遵守。

补充：没有援引法条是我的疏忽：
《公司法》第四十四条 股东会的议事方式和表决程序，除本法有规定的外，由公司章程规定。
股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。
个人认为，根据此条第一款之规定，在不违法的情况下，公司章程制定的规则具有最高效力。而此条第二款则是设立了特别决议的最低限制（即三分之二以上），如果公司章程规定比其更高，我觉得没问题，而如果公司章程低于此标准，那就是违反强制性法律规定了。
你觉得呢？