GBA是不是一输入金手指爆机后就会没有了存档？

不是啊，口袋绿宝石有一个bug，不论用不用金手指都会出现，你在打完四天王后，保存妖怪记录后，结束动画开始的时候（就是主角骑自行车的动画）刚出来是立即关机，再开机，记录就在了。

口袋吧下的好像不会

没错，修改器也是。