请问如何控制工件的同心度?

ok，因为对产品不了解，究竟是属于细长轴，还是普通轴呢？直径多少？同轴度要求多少？加工工艺是怎么样的呢？刀具是采用的什么？切削参数呢？
那我只能猜想了，最大的问题应该是切削材料的问题，因为铝管容易变形，解决这个还是要从切削参数上来实现，多试验不同的切削参数，看变形的情况，找出最合适的。或者可以采用不同的刀具进行试验，因为铝件材质的不同，各个镗刀片的切削情况也不一样的。

你的装夹方法和切削参数可能有问题，只能是猜想了。
我个人建议 管制工件的装夹尽量在端面，或者同型装夹，以免装夹时照成工件变形，这样可以极大的控制自由度，切削采用高速 低进给。刀尖锋利，使用合金刀具比较好。