利用ncbi查询蛋白质,可以获得protein的什么信息?

来源:百度知道 编辑:UC知道 时间:2024/05/18 01:42:41
我要利用ncbi写一篇关于木聚糖酶的论文,通过木聚糖酶的基因查找到了其相对应的蛋白质,做成了fasta格式放到blast找了同源,然后找够几个放在一起比对一下,还可以做什么?望高手指点一下!
进化树我知道
mega跟bioedit那啊
比对不就是做进化树吗?
怎么获得蛋白质的三维四维结构?
哎··

1、进化树分析。利用基因序列和氨基酸序列做一下进化树;
2、如果已经有了某个木聚糖酶的三维或四维结构,可以进行蛋白质模拟构象
别的也想不起来了

补充:1、进化树分析不只是做一个比对,而是对蛋白的进化过程做出图谱,建议查一下相关的期刊了解一下;
2、有专门的软件做三维四维结构,但必须有已知结构的同源蛋白做为建模的基础。也可以根据一级结构分析蛋白质的二级结构,二硫键等。

可以查到蛋白质的二级结构的组成啊,这样就可以分析其化学特性了。
还有特殊的结构域