因为在宅基地上与对方发生纠纷,并没有打他,反而对方却说打了,并在医院检查,有骨折现象.我该怎么办?

以事实为依据，以法律为准绳
这是法律实施的基本原则。法律上是讲究证据的，而不是靠一面之词，根据你的情况，一个村里发生这种情况，在现场的人一定有很多，你可以充分收集在场人的证言证词。
可是毕竟是一个村子里的人，抬头不见低头见的，希望不要把事情上升到法庭相间的角度。通过村委会调解解决问题才是最好的出路。

他要提供证据的，否则不用赔偿

首先，对方主张赔偿，必须举证证明你有侵权的行为并且该行为与对方造成的伤害有因果联系．
其次，如果没有实施该行为，应该选择按照法律程序来解决，不要进行私了．
对方提供不了证据，你不用承担赔偿责任．

找律师

没有打他，怎会结果会是骨折？

打没打大家心理清楚。前面的朋友已经说了，人证将是你在法律诉讼中最大的法宝（当然前提是你没打，或你这方没打）

村委调解将是最现实的解决途径，通过双方合理的退让，以及村委会根据实际情况的调整（是否有可能重新划分你的宅基地？）

翻脸后，即便你占理并把房子修好了，难免与这位门前屋后的邻居在日常生活中互生怨恨。我想，即便土地风水再好，你也不会住得安心吧。。