As the Indian plate continues its crash into Asia—sometimes in jerks marked by earthquakes

当印度板块持续挤压亚洲板块的时候--有时明显表现为地震的震动.
marked by earthquakes是指明显表示,表明是地震

没有with啊

这句话的意思是说
由于印度洋板块持续活动冲击着亚洲板块，很多时候剧烈的冲击以地震形式发生
你的句子还没说完，后面还有内容，到这里为止，都只是as引导的原因状语

marked by 字面的意思是”标示为”，实际的意思应当是”代表／象征”吧

正当印度(洋、大陆)板块冲撞到亚洲板块，有时候猛烈的拉扯很显明的(marked by)地震出现