变身的柯南

188 生死一瞬间 洞窟中的侦探团 (命がけの复活～洞窟の探侦団) 2000/05/01
189 生死一瞬间 负伤的名侦探 (命がけの复活～负伤した名探侦) 2000/05/08
190 生死一瞬间 第三种选择 (命がけの复活～第三の选択) 2000/05/15
191 生死一瞬间 黑衣骑士 (命がけの复活～黒衣の骑士) 2000/05/22
192 生死一瞬间 新一回来了 (命がけの复活～帰ってきた新一…～) 2000/05/29
193 生死一瞬间 约定的场所 (命がけの复活～约束の场所～) 2000/06/05

其他还有很多的，这几话很经典..

新一出场：
001 云霄飞车杀人事件
048 外交官杀人事件（前篇）
049 外交官杀人事件（后篇）
162 飞机空中密室！工藤新一的首次的办案
188-193 危命的复活系列
219 被召集的名侦探 新一 VS 怪盗基德
286 工藤新一NY事件(事件篇)
287 工藤新一NY事件(推理篇)
288 工藤新一NY事件(解决篇)
400 心存疑惑的小兰（回忆）
437 上户彩和新一 4年前的约定(回忆)
472 少年工藤新一的冒险（前篇）
473 少年工藤新一的冒险（后篇）
490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决(国中时)

剧场版7 迷宫的十字路

变回新一的话,只有48-49、188-193 危命的复活系列、剧场版7
另外前面有人提到345集并不是新一出场，只是服部扮成了新一

048-049 外交官杀人事件
188 生死一瞬间 洞窟中的侦探团
189 生死一瞬间 负伤的名侦探
190 生死一瞬间 第三种选择
191 生死一瞬间 黑衣骑士
192 生死一瞬间 新一回来了
193 生死一瞬间 约定的场所
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重迷案
剧场7迷宫的十字路口

第一集不算的话..还有