一个mysql数据库可以存放两个不同网站的数据吗

可以，但前提是这两个系统的表名不能相同，一般来说安装系统的时候都要在数据表前面加个前缀，只要加个不同的前缀就行了，或者说只要是表名没有相同的就行。

应用的字段名相同,就可以如你说所得用一个用户名.

如用到其它的表,重新建一个不就行了吗?

可以，创建的数据库名不同就行。