“硝化细菌能以NH3作为氮源和能源物质”这句话对吗？

利用大气中游离的N是豆科植物的根瘤菌
硝化细菌是以NH3作为氮源和能源物质。没错！

错的。。
硝化细菌的确把NH3转换成NH4+，但NH3只能做氮源！
注意，自生固氮和自养不一样！
自生固氮指固氮方式，自养为新陈代谢同化作用
硝化细菌为原核，异氧需氧型，培养可以不提供氮源，但碳源不可少~

这句话是是对。但是硝化菌也有亚硝化菌和硝化菌之分，亚硝化菌才是利用氨（NH3）作为氮源的和能量物质的。而硝化菌则是利用亚硝基作为氮源和能量来源。他们就是利用氨合成亚硝酸 硝酸并且释放能量。
你说的利用大气中的游离氮的菌的名字叫做固氮菌，还有就是寄生性很专一的根瘤菌他和豆科植物一起共生。
还有就是一些藻类了如常与满江红共生的蓝藻中的项圈藻(鱼腥藻)。

硝化细菌的确是将土壤中的氨转化为硝酸盐,从中得到能量用于自身合成有机物.