该公司该怎么办呢?

首先，公司既然已经决定同意他们辞职，就不能反悔，
如果没有同意，可以根据公司需要去断定是否通过加薪挽留，现在说这已经没用了。
关于新工程师甲，既然谈妥薪资，就让他按照贵公司要求工作，应该和离职工程师标准一样。
工程师乙，虽然公司有迫切需要，但也不能做亏本买卖，可以根据业绩，绩效等补偿他，但原则上是十万年薪，做的好，按效益再拿提成不封顶，有可能比二十万更多，不是大家都满意吗？
当然，为了平衡两位工程师的福利，可以采用工作任务、压力等分配制，多劳多得嘛。
如果乙不同意以上，那就再继续招人吧，高薪技术层可不能马虎，那可关系到公司命运的

为什么不挽留离去的工程师呢？

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