磷化物对植物的抑制机理是什么？

不应该有影响，至少不是磷矿石的影响。
自然界的磷矿石都是些如磷酸钙、磷酸铝之类的不溶性矿物，植物根本无法吸收。如果要问磷矿开采后在废矿上的植物为什么长不好，可能是因为开矿后，岩石裸露（石漠化），土壤肥力下降（或土层太薄），导致植物难以生存。