China has managed to come to terms with the long term existence of some of these groups

中国已经就这些团体中的一部分的长期存在达成协议。

中国已经接受了这些组织的一部分的长期的存在

has managed to 成功的做某事，不过语境上我觉的这里还是有点最终同意，接受的意思
come to terms with 有妥协的意思the long term 长期的

中国已经和这其中的一些团体达成长期共识

中国已经尽力对某些团体的长期存在进行了让步。

中国已经成功的与其中一些组织达成长期协议。

中国已经接受了某些这类团体的长期存在。