我的港澳通行证上的签注是1次香港1次澳门 请问我去澳门还能再回香港吗

可以，你在从澳门返回香港的时候可以坐船，这种快船和香港机场有相应的关系，下船后会有机场大巴直接送你到香港机场的出境大厅，这样就不算二次入境香港了。当然你也不可能再从机场出来了，只能飞回北京。