分支机构的税务登记证在哪办？

应该到经营所在地税务机关办理注册税务登记。

非独立核算分支机构，因未办理分支机构营业执照，所以不需要办理税务登记证，由总机构统一纳税。

分支机构应该办理税务登记证。《中华人民共和国税收征收管理法》实施细则第二十一条规定：
从事生产、经营的纳税人到外县（市）临时从事生产、经营活动的，应当持税务登记证副本和所在地税务机关填开的外出经营活动税收管理证明，向营业地税务机关报验登记，接受税务管理。
从事生产、经营的纳税人外出经营，在同一地累计超过180天的，应当在营业地办理税务登记手续。
分支机构应该属于第二款的情况，因为既然是分支机构，其在外地的经营期限肯定超过180天，应该到经营所在地税务机关办理注册税务登记。