在法庭审判时证人当堂翻供，法官应该怎么判决？是按照公安机关的口供笔录还是按照证人的当堂供词？

最重要的是证据能证明哪一个说法
证人翻供只能是公安机关的笔录的证明力下降
不会说法官就绝对地相信哪一个
还是得看其他证据

如果是一审普通程序，没有特殊情况，证人是需要出庭作证的，光有笔录是不行的。所以即使公安机关把证词改了，如果它们没有买通证人，那么证人出庭作证时候就会说出实情。以证人当天作证的证词为主。而且公安机关的相关人员也会因此触犯刑法，职权犯罪。徇私舞弊。