请问第二批B段的最低分是本科线么？

当然不是。
之所以要划本科线是为了将全省考生分批录取。共分成三批，所以有了一批本科线，二批本科线，三批本科线。
学校录取也是根据批次录取，至于学校录取的最底线则根据考生报考情况而定，但学校录取的最底线必须高于或至少等于该批次本科线