03,04 年的主板用AGP桥接显卡是不是会不兼容?

不清楚，一般那些主板都用的FX5200或者ATI9550。

6600显卡出来的时候，PCI-E显卡还没流行，当然是原生的，6字头的显卡只有很小一部分是PCI-E接口的，7字头的显卡出来时，才是PCI-E显卡真正流行起来的时候

03、04的主板插6600是可以的,绝大多数都不会不兼容,除了极少数的垃圾杂牌外。