しかし、大山村では横浜市との话し合いがつかない限り、ゴルフ场の建设は行わない方针です

这里的“は”表强调，强调高尔夫球场的建设！
如不表强调的话，句子则为“ゴルフ场の建设を行わない方针です ”

？？？

但是方针是，除非和横滨市达成协议，否则就不会再大山村建设高尔夫球场。

没什么不对的吧。。。。。。日文可以这样说啊 不一定要按汉语的通顺与否来看 日语有日语的思维。

这句话是判断句，但主语省略了，所以不是～は～です的句式。日语中的主语常常会省略，一定要注意。
这句话应该翻译成
但是，我们的方针是，如果不能和横滨市达成协议就不在大山村建设高尔夫球场。
“は”是用来强调否定的，不是提示主题的。