年低分公司的本年利润能用内部往来科目转到总公司吗?如果不能应怎么转?

分公司不作利润分配就是了。
你这样的是怕双重征收所得税吧？让总公司用成本法记长投，这样你不分配他就不用在会计上做处理，当然，不是实际得到的投收也不会征税，主要是避免麻烦。
然后把钱直接“借给”总公司就是了，这样总公司又拿了钱，又不用缴税。
还有，你们的公司章程得好好做一做就是了。税务上门找麻烦的时候，请客吃饭最重要，会计做账是次要。

不能。必须通过正常的利润分配途径。