关于农村荒山承包开发遇到纠纷

“后来村里和镇里有出具了一个证明，证明实际面积是126亩，原来的合同继续有效，承包有效”

这就好办，说明你的合同就是承包了126亩了。

关于村与村的界限你不用关心，两个村有争议他们应该向上级土地或政府部门提出定界申请，有关部门会做出界定。另一个承包人无权直接向你索要土地。如果他敢破坏你的树苗你可以报警，林木砍伐是需要办理正规手续的，故意损坏树木是违法的行为

假如你真的越界了，你载的树苗也不会白种，如果是你承包村的村委会搞错了造成了你的损失他应该赔偿；另外，即使你不知情的情况下真的占用了邻村土地，你对土地是善意利用，相同承包条件下（和那个城里人相同的承包价格）你也应该有权根据现状优先承包邻村的这些土地。如果同样条件下他们故意不给你优先承包逼你让地，你可以到市、省土地局、农林局、信访局以及政府去上访反映这些问题，他们应该也不敢违法毁绿。

1、首先可以要求镇的土地科人员进行勘界
如果确实越界了，没话好说，只能让出，你的屯没权利出租别的屯的荒山
2、如果无法勘界，那么双方协商解决吧
3、到了法院，法院也得依照勘界来判定你是否侵权
4、证人不是证明地界的证据
土地到底是谁的应以勘察地界书之类的公文、证书为准