是不是硬件的兼容性都取决于主版?

不是，还要看所换的硬件。比如说两条内存，如果不是同一厂家生产就可能有兼容问题。
主板有型号的，硬件于主板之间的配对还要看主板是否支持该硬件。如果机子很老了，换块最新的主板，那么新主板肯定不支持原来的老硬件。硬件的类型很多，建议问问卖主板的商家