高等代数一门与基础课三门（操作系统，数据结构，离散数学）选哪个比较好啊？

这个要看复试、面试考什么！
就目前几门，就选高等代数。

对编程来说，数据结构和操作系统是重要的，比高等代数、离散数学容易。
操作系统里只是调度算法有难度，
离散数学内容太多，抽象代数部分不比高等代数容易，
三门课加起来肯定比高等代数难。

高等代数确实比较抽象，尤其是线性空间以后的内容。
但是同后面三门加起来相比，应该算容易的。

高等代数=线性代数+多项式理论+线性空间+线性变换+λ矩阵+欧氏空间，
如果不是纯数学系的，一般就学这么多。

前两门，操作系统完全是自学，数据结构有助于对于计算机存储和程序开发有更深层的理解，建议好好学。离散数学就没接触过，不评价。

这取决于你打算以后怎样发展！