做脑部CT是不是对脑部的任何地方不论表面还是深层的病变或者异常都能看出来？

没有那么神奇……但CT通过不同物质的密度变化很容易观察到异常的变化……部分不容易鉴别的病变通过增强对比可发现……
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脑囊虫病吗？CT比MR对囊虫头节钙化更敏感些

不是

不是的，CT是对有器质性的病变才能看的出来，如果只是一些比如电位啊、活动啊这些非器质性的改变是看不出来的，比如有的癫痫病人，头颅CT是可以完全正常的，但是做脑电图的话可以看到有的地方没发病的时候活动减低，发病的时候活动异常增强。