在北京开一个环保厕所型小卖部应该如何申请

厕所适当收费是经过上级部门同意的，但厕所当小卖部经营，是绝对不允许的。另外，每个厕所都是24小时全天服务的。
你的这种想法是人为的变相操作是违规的，所以谈不上合法申请，只能走关系，到环保和城建部门去找熟人吧！

哇，好难！