限制性内切酶是智能识别一种特定的核苷酸序列（例如GATT)还是边缘的两个核苷酸？(例如G```C)

限制性内切酶是能识别序列！它有一种对应！就是A~T，C~G，比放说一个序列是—AGCTGC—，而与之匹配的限制性内切酶能识别它，就从这个序列的两边，也就是生物中磷酸二酯键!所以讲了这么多!你的答案就是前者!

限制酶是基因工程中所用的重要切割工具。科学家已从原核生物中分离出了许多种限制酶，并且已经商品化，在基因工程中广泛使用。根据限制酶切割的特点，可将它们分为两大类：一类是切割部位无特异性的；另一类是可特异性地识别核苷酸序列，即只能在一定的DNA序列上进行切割。这种能被特异性识别的切割部位都具有回文序列，也就是在切割部位，一条链正向读的碱基顺序与另一条链反向读的顺序完全一致。在基因工程中使用的多数是后一类酶。限制酶在特定切割部位进行切割时，按照切割的方式，又可以分为错位切和平切两种。错位切一般是在两条链的不同部位切割，中间相隔几个核苷酸，切下后的两端形成一种回文式的单链末端，这个末端能与具有互补碱基的目的基因的DNA片段连结，故称为黏性末端。这种酶在基因工程中应用最多。另一种是在两条链的特定序列的相同部位切割，形成一个无黏性末端的平口。

限制性核酸内切酶根据其功能可分为一级和二级两大类。在基因重组，基因解析方面广泛使用的是二级，一般情况下识别由4~8个碱基构成的特定序列有选择地将其切断。一级限制性核酸内切酶则跟特定的碱基序列结合，切断位置上不具有特异性。
以典型的二级限制性核酸内切酶EcoRI为例，识别5’-GAATTC-3’这一序列（双链中的另外一条链为3’-CTTAAG-5’）将各链上连接G（鸟嘌呤）和A（腺嘌呤）之间的磷酸二酯键切断生成两个DNA的断片。
由该例子可见，在许多场合，限制性核酸内切酶识别的地方是一个回文序列（palindrome），在这个位置上呈锯齿状切断后给生成断片的末端一个单链部分（叫做附着末端）用同一种限制性核酸内切酶切断的断片的末端是互相吻合的，所以使用连接酶就很容易把这些结合起来。这就是 “剪刀与糨糊”这种说法的由来。