含有免税收入的企业,在计算所得税时，捐赠如何扣除？

根据新税法的有关规定，企业发生的公益性捐赠支出，在年度利润总额12%以内的部分，准予在计算应纳税所得额时扣除。这里的年度利润总额，是指企业依照国家统一会计制度的规定计算的年度会计利润。

因此，公益性捐赠支出的扣除限额，应当以按照国家统一会计制度的规定计算的年度会计利润为基数计算确定。当题中的“免税收入”在会计中被确认为一项收入的话，那么，作为计算公益性捐赠支出限额的基数的利润总额，也当然包含了免税收入对利润总额的贡献额。