刚入职,公司分两派我该怎么办?

这个主管是你的直接上司吗？首先一点，做好自己的本职工作，在不影响工作的前提下，不要随便给别人使唤，容易造成不必要的牵连。
建议一般靠拢自己直接上司。

自成一派，左不拥，右不抱，到时自然 有人来拉拢你。人家一家人，就算你进去了，人家一样拿你当外人，主管孤军奋战，你直接跟他也会不太舒服 ，新人嘛，放低姿态。少说话。看，观察。学习

保持中立，和任一派都保持一种正常的工作关系。
你就记住，来公司是工作的，所以你关心的只是如果按照你的直接上级的要求做好你应该完成的工作就行。特别是，不要参与评论与你工作无关的事情。你做的工作都是对事不对人的。

哪边都不靠 尽力做好自己的事情 时间久了 你的为人怎么样 大家都是看在眼里的

做好自己的工作，这些问题不用考虑太多。