怎么有的公司有那么多文件，对于不同的部门，分别有那么多的指导书或方案政策等

每个企业的具体情况不同，所以管理文件体系也不尽一致。作业指导书是对具体管理行为的指导作用，所以相比程序文件更多更细一些。但往往企业的管理体系中也有共通的或者相近似的部分。一般在行政、财务、人力资源等不太涉及行业专业性的方面。

指导书的多少取决于公司的性质,规模,生产方式以及管理的程度等多种因素,企业可以根据自己的实际需要增加指导书和方案.
需要强调的是指导性的文件并非越多越好,够用就好.