Has Tom been late,这是什么时态

这是完成时态。这里所说的时态指的是动词的时态。你看，BE动词也是动词么！

形容词,名词,介词等没时态,只有动词有时态.
这个是现在完成时.
也就是Have + 动词的完成时态。

应该是虚拟语句吧?还有应该是had Tom been late, 意思是“如果汤姆迟到了..."

现在完成时.LATE是动词

这是现在完成时的疑问句，late是形容词。中文应该是 "Tom已经迟到了吗?"
可以变成陈述句：Tom has been late.
完成时一般表示对现在还有影响.

完成时态。

时态是对动词而言的。形容词没有时态