扼要说明蛋白质分子的空间结构及共化学键

20种氨基酸的结构除Ca及与其相连的-NH2、-COOH和-H外的其余部分（称R基团）各不相同（图2-2），使之具有各不相同的理化性质。20种氨基酸可根据其R基团在中性溶液中的极性和解离状态分为三类：中性氨基酸（非极性疏水性氨基酸和极性疏水性氨基酸）、酸性氨基酸和碱性氨基酸。中性氨基酸又可按其R基团的结构不同，分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸、亚氨基酸和酰胺类氨基酸。

半胱氨酸是含硫氨基酸，在蛋白质分子中，有时2个半胱氨酸残基上的巯基脱氢，以二硫键（disulfide bond）相连，形成胱氨酸。脯氨酸是惟一的环状亚氨

基酸，其Ca与侧链基团之间共价相连，形成吡咯环，在蛋白质的空间结构中有其特殊的作用。此外，在一些蛋白质中还含有某些特殊氨基酸。如甲状腺球蛋白含碘代酪氨酸，胶原蛋白含羟脯氨酸和羟赖氨酸。这些氨基酸是蛋白质合成后经修饰生成，在人体内没有相应的遗传密码。