有两个Excel文件，要进行比较，将表中不同的部分用颜色标出

打开2个工作薄
使第一个成为活动工作薄
运行下面的宏

Sub Macro1()
For i = 1 To 3 '3个sheet
Sheets(i).Cells.Interior.ColorIndex = xlNone
For Each cl In Range(Sheets(i).Cells(1, 1), _
Sheets(i).Cells.SpecialCells(xlCellTypeLastCell))
r = cl.Row
c = cl.Column
If cl.Value <> Workbooks(2).Sheets(i).Cells(r, c) Then
cl.Interior.ColorIndex = 6
End If
Next
Next i
End Sub

比较麻烦,建议装office2007,自带通过颜色筛选的功能.如果是excel2003，需要添加辅助列，用定义名称的方法得到对应的颜色号，然后对辅助列进行排序：
颜色单元格在A列，选中B1,插入->名称->定义，输入a，下面输入公式
=get.cell(24,$a1)，此法可得到字体色的序列号
B1输入
=a
将公式向下复制到相应行。
将全表按B列排序即可。

若是想获得背景色序列号，将24改成63即可

你可以使用DOS下的比较命令来实现。
FC——文件比较命令
格式：FC[盘符：][路径名]〈文件名〉[盘符：][路径名][文件名][/A][/b][/C][/N]

选中要填充的区域然后在工具栏的右侧有一个桶状图标（填充颜色）按钮，挑选你要填充的颜色就可

选中一个工作表的数据区域——格式——条件格式——单击条件1的下拉箭头——选择“单元格数值”——运算符选择“不等于”——在右边的文本框中输入“=sheet2!a2”单击“格式”——选择颜色
（假设你的另一个表格在Sheet2）