发票抬头有两个公司名称，还能不能入账？

能，你公司开具原始凭证分割单，对方公司就能入账了

可以。

实际上，你还可以在取得的发票上用相应的笔自己添上注明（填像点）。
例如，把客户公司画个括弧，注明：客户公司。

当然不能了，只能有一个单位名称。

不能，你应该到给你开票的公司，划掉代理客户的名称，在让开票公司补盖发票专用章或财务章。