我想把托管在就业指导中心里档案转到人材中心能行吗

可以的。
你毕业两年了，我不清楚还能不能按照改派办理。如果可以就办理改派！但是，似乎你的情况更应该按照正常的人事调动办理！

能告诉我你当初毕业的时候有报道证吗？
如果有，改派手续是这个样子的：和原单位解约，与人才市场签约。带报到证，解约函，新的就业协议书到人才市场所在的人事局办理改派手续！

如果是人事调动，那我就不是很清楚了。似乎可以直接到就业指导中心办理。

你可以先咨询一下当初毕业学校的就业指导中心，请那里的指导老师为你解答！

祝你早日办理完！