店长能否忍痛割爱

实际上，这是在做一种权衡。
一方面，如果陈走掉，就会严重影响药店的业绩，而且，把一个其他方面非常突出的员工弄走，你并不能保证可以招到同样的人。这种开除的成本非常之大：营业额的直接损失，熟练人员带动及晕轮效应的失去的损失，重新招聘的费用损失，新人入职的培训损失，新人业务不熟练所带来的损失。这其中还不算店长与朋友反目的损失。
另一方面，如果陈不走，将使制度的尊严破产，将使其他人员效尤，而且陈也不好工作有可能自动离职。店长的威信受损。可能的损失：潜在的被盗的损失，制度严肃性被破坏带来的潜在损失，陈不能安心工作造成效率下降的损失，其他员工因负激励所产生的怠工损失。但也要看到，其实继续被盗的损失，陈走与不走都是存在的。过去陈在，不是发生了这样的事吗？
比较而言，陈走，损失大；陈不走，损失小！

现在就你提供的信息，谈谈如何解决这个棘手的问题。
大的方面，即陈走损失比陈留下来大这一点确定之后，我们要做的是如何规避或者说消除陈留下来，可能带来的损失了。
1 过去的防盗办法显然不够有效，得找到新的措施（这个我无能为力）。
2 与员工一起讨论修订制度，为什么让他们参与，就是为了让他们充分了解制度，并认可制度。（不展开了，这方面在大公司也是一样的。）
3 陈的事，由店长出面，召开一次会议，明确告知，就在事发前几天，某次喝酒时，店长告诉了陈，可以将这些东西拿去卖，云云。不管员工信不信，反正就要这么说。或者类似的“技术性”地处理一下。我们不可能让员工完全信服，但一定要给个小陈非盗的“官方确认”。这样以来，小陈就被洗净了。他也好工作。当然，小伙子要忍受一段时间别人的议论。也就如此而已，十天半月的，就过去了。
4 私下找个时间，狠狠收拾小陈一顿。最好让他亲戚也参与。第三步就是在“收拾”之后进行。要叫他感恩戴德，知道“你的好处”，公司对他的评价。要他既不可能再犯旧错，甚至比过去更积极。我之所以说不要调动他，是因为这样做对黄没有什么好处。对本店没有好处。而且，这事如果“传到”他新单位去，他照样没有办法工作。
5 ......（现在得哄孩子，就不想了，嘻嘻。）

开除
然后私下教育过后，确定小陈人品没问题的话，再推荐到别的地方去

8开除~~~一个有人情味