xp系统中在开始菜单关机后，显示器显示已关，但是主机一直在运行。

不太可能吧？！
主机如在工作，第一位监测的就是显示器！
现在它把显示器都关了，证明所有程序已经注销，视窗已完全退出！
至于主板指示灯及鼠标指示灯仍亮，是主板处于待机起动状态，与电视遥控有些类似！
如果你想彻底关机，此时可关断电源！

--寂寞大山人

可能是电源按键的问题，楼主所说的主机在运行是根据什么？风扇在转吗？如果只是这样的话就没问题了。

重装系统.还不行就是硬件问题,很可能是电源.