在NCBI上找到了一个基因，如何将它与上一个基因之间的不编码序列找到？

来源：百度知道 编辑：UC知道 时间：2024/05/25 15:21:16
想看看这段序列对基因的影响，可以通过查看整个染色体的序列找到这一段，不过染色体太长了，电脑几次都下不下来，已经知道序列的起始和结束的碱基位置，有其他的方法下到吗？
NCBI新手，请尽量详细！谢谢。

在你查的gene网页上，应该有一项Genomic context，显示你查的gene附近的gene及方向。查上游gene的information可以得知其起始和结束的碱基位置

同样在你查的gene网页上，应该有一项Genomic regions, transcripts, and products。单击那个NC_****（这个是此gene所在的染色体区域），会有两个nucleotide选项，选择FASTA，就连接到NCBI sequence viewer，显示整个gene的序列。改变显示区域range到你gene的起始点和上游gene的结束点，就可以找到两个gene之间的序列。

更好的方法是去UCSC genomic browser，直接输入你要查的gene，然后zoom in zoom out genomic region就可以看到你的gene附近所有的genomic/epigenomic/expression/regulation……的信息，非常非常powerful！！！
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway