个体工商户法人和经营人不一致，可否罚款

当然有法律依据。
《城乡个体工商户管理暂行条例实施细则》里面规定：营业执照不能转让和租借。也就是说，以你的名义申办的营业执照，转交你岳父经营，本身就是一种违法经营行为。罚款3000也在条例规定范围以内，可以说工商局这样处罚你是完全有法可依的。
不过你可以和工商局讲清楚实际情况，你们是亲戚关系，以此来求求情，如果问题不大的话工商局可以免于处罚的，毕竟只是很轻的违法经营行为。要是工商非要罚你也没辙，毕竟错是在你……
另外，售卖食品当然要先领取《食品卫生许可证》（领取的同时要办理健康证），这是法律法规明文规定的。否则不仅工商局，连卫生局都有权查处你。
楼主啊，请增强你的法律意识吧。

个体工商户的经营形式有两种,一种是个人经营,一种是家庭经营,如果你是属于前者,而且该店与你无关,完全是你岳父在经营,那么就不行,但这种情况工商局一般也不会查处的呀,你随便说一句请你岳父在看店不就行了?怎么会闹这么大?如果是后者则完全不存在无照经营,家庭经营的经营者只要是你家庭成员就行.

有，你这样就是无照经营了，要个体户上注册的名字和经营者一样的。特别是经营食品的，如果你想啊，你注册时你是去体检的，你身体好的，给你办了证，但是并不意味着你岳父体检通过的，而经营的是他，如果有什么问题那不是挺严重的