特许经营权能充作有限责任公司的注册资本吗

依照法律规定不可以！
《公司注册资本登记管理规定》第八条
发起人可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资。
股东或者发起人以货币、实物、知识产权、土地使用权以外的其他财产出资的，应当符合国家工商行政管理总局会同国务院有关部门制定的有关规定。

发起人不得以劳务、信用、自然人姓名、商誉、特许经营权或者设定担保的财产等作价出资。

该条第三款明确特许经营权不可以作为出资。