我家在农村是镇里的特困户，有亲戚的帮助出一点经济的力量，现想用水田改建住房需要办那些手续？

盖房子要先申请宅基地，要经县国土局批准，否则就会出现你说的罚款、拆房。
二楼说的不对。耕地分为一般耕地和基本农田，都不许占用。如果强行占用，处罚的方式不一样，占用一般农田处分轻一点而已。
一楼说的更不对，怎么可能会不办手续。

理论上农田是绝对不允许用来建造房屋的，国家明令保护耕田。但实际操作中认为该“耕田”应当理解为基本农田，即粮食生产基地等。你们如果能征得村委会同意并记录备案，应该可以的，不过通过的可能性不大，毕竟是将集体土地实际转化为私人使用。

山区应该不用什么手续吧.我们家在一个小市连上好像也不用办什么手续