月收入5000元,但由于单位现金流不足,仅发放2500元,应如何纳税

如果楼主指的是您个人如何申报纳税的话,这里的工资发放，由企业代扣代缴个人所得税-工资薪金所得，可以按照实际发放数扣缴个税，也就是按照2500扣缴。至于剩下的2500在以后的月份发放时再与所在月份收入合并扣缴个税，那样就是税负较高了！
建议：尽量将工资所得在一年的12个月中平均一些，本月没有拿到5000，但也按照5000申报纳税，不与以后月份发生的工资合并缴税！
毕竟个人所得税-工资薪金所得是9级超额累进税率！不同档的收入水平所承担的个税压力是不同的！
补充一个：不存在纳税风险问题，相关个人所得税申报缴纳的文件尚未明确到这一点呢！

按2500元纳税

按2500,再发再计税

应该按实发工资缴税，但你单位要注意，如果未发工资挂帐的话，有可能是年末不让抵扣企业所得税的，这个要看你的挂帐工资在什么时候补发！