我父亲病了，在农村上了医疗合作保险，过几天想来北京做手术，术后能否凭相关资料回当地进行报销？

一般情况下，可以直接北京这边医疗，然后凭相关费用单据，病历、诊断材料、出院小节等回老家进行报销。
注意，比较省心的还是让你父亲那边咨询一下当地社保局（因为也有的地方需要递交异地医疗申请）。
目前国内各地社保差异很大，不少情况下我们的回答是有误差的，因此对于社保咨询者，为了保护自己的利益，我一直强调，这里只是做个了解，最好还是通过当地社保中心（官方电话12333）进一步确认为准。

一定要先在参保地医保申请异地就医和办理转院手续的，否则不给报销

可以的，只要当地医院开具转诊证明并有当地卫生局合作医疗办公室的同意就可以，但报销率会降低

有些可以，不过要有医院的诊断证明，病历的复印件，而且要有下级医院转诊证明

这个得看您当地的具体的情况啊

可以报销，但是比例很低的。