尖锐湿疣会不会长到JJ尿道口里面很深的地方去

会的，见过这样的病人，但是比较少见。
这样就很麻烦，需要做外科手术，把你的JJ切开。或者泌尿科的的尿道镜也可以。

不过由于这个手术的复杂性，泌尿科与性病科有可能会存在互相推诿的现象，楼主还是要选择正规一点的医院。