测出来的序列里找不到pcr 引物序列

来源：百度知道 编辑：UC知道 时间：2024/06/21 07:31:56
我用16srdna鉴定细菌，拼出来的序列里面找不到PCR引物序列，有没有可能会影响结果。这个序列到底是不是鉴定菌的序列啊

你拿到的测序结果，是从引物开始后面30－50个碱基以后开始的序列，引物序列是看不到的。这个和测序机器的性能有关。一般从引物开始的一小段序列出峰会很不稳定，有稳定峰图可以读出序列一般都是20－30个碱基之后了。你手头若是有峰图结果你看看最开始那段的峰图就知道了。

至于拿到的序列到底是什么，ncbi上blast一下不就什么都知道了

你看看你的测序结果是不是你连接的测序载体。

当然找不到了
测出来的是引物的互补序列
而不是引物序列
只要测序成功
是肯定能找到互补序列的

有可能是你根本没扩出来东西.还有就是在扩增的过程中你的引物导致整个扩增发生原位突变,使的你阔增出来的片段在某个位点突变.这样的话你可以在查找过程中将引物序列减少一部分在查找