遗传多样性分析

根据你的问题，你做林木的遗传多样性分析应该是一种或者近缘种的分析吧。

（1）DNA标记方法中，现在最有效的是用微卫星标记（如SSR标记），但是微卫星有时候不好扩增，可能需要较长的摸索时间；因此RFLP和AFLP等老方法也可以一用，优点是速度快。
（2）对于遗传多样性分析来说，等位酶分析更好。同工酶是功能相同的一类蛋白质，但是它们的编码基因不同，因此并不能很好的反应同种不同种群或近缘种间的遗传多样性关系；等位酶是由同一个基因的不同等位基因编码的，有进化上的关系，更适合用于遗传多样性分析。
（3）蛋白质水平上，可以用凝胶电泳技术检验蛋白质条带的多态性（这是也比较常用的）；也可以直接蛋白质测序，但是这个成本高，并且有些蛋白测序难度大。