我司主管，因他在职期间曾用我公司名誉跟他自己工厂的客户发生业务，现因他离职想写联络函告知客户，

这种函不能写的太露白，否则就可能构成名誉侵权，到时候吃不了兜着走．我建议你只要写明谁谁谁因个人关系已经向公司提出正式离职，不再担任什么职务，且已经于几月几日正式办理交接手续．现发函告之，具体业务由谁接管．

祝你公司事业越来越好，职务节节高升！