unix里cp或者chown命令后面的-r参数是大写R还是小写r

cp后面跟r和R都可以，效果差不过，都是递归地对目录进行copy操作
chown后跟的是R，是对目录进行递归change owner操作

小写

chown:
-R, --recursive operate on files and directories recursively

cp:-R, -r, --recursive copy directories recursively

至于其它的命令，你可以在使用之前，先man <command>,查找下你使用的命令的说明，里面会提到它的选项的。要会用man命令，它会解答你的疑惑。。。